مسجد السلطان قابوس مستوحى من العمارة الإسلامية التقليدية مع دمج العناصر الحديثة أيضا. تم بناء المسجد من مواد محلية مثل الرخام والحجر الجيري والحجر الرملي. قاعة الصلاة الرئيسية هي النقطة المحورية في المسجد ويمكن أن تستوعب ما يصل إلى 2500 مصلي في وقت واحد. يوجد أيضا فناء جميل ومكتبة وقاعة محاضرات في المسجد. قبة المسجد ، المصنوعة من 14000 طن من الرخام ، هي واحدة من أكثر معالمه لفتا للنظر. القبة هي الأكبر في العالم ، حيث يبلغ قطرها 50 مترا وتزن أكثر من 4000 طن. يحتوي المسجد أيضا على أربع مآذن ، يبلغ ارتفاع كل منها 90 مترا وتمثل واحدة من المدارس الفكرية الإسلامية الأربعة.